http://www.yuyong.net

Origin Pro如何快速绘制火山图教程 origin做图教程

火山图一般出现在生信或者组学的文章中,用来展示显著差异表达的基因。显著就是p值小于0.05,差异表达就是说两个基因表达的差异,一般按照Fold Change(倍数变化)≥2作为标准。 volc...

火山图一般出现在生信或者组学的文章中,用来展示显著差异表达的基因。显著就是p值小于0.05,差异表达就是说两个基因表达的差异,一般按照Fold Change(倍数变化)≥2作为标准。

volcano_plot App

链接:https://pan.baidu.com/s/1bR3NZl7AOuqJLvnffetqCw

提取码:gszw

数据准备这里我给大家准备了一个练习用的数据,大家可以下载下来进行练习。

链接:https://pan.baidu.com/s/1VCM8R5FMLaR1t6KxsDwgUw提取码:uh78Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程

数据介绍这里我列了一个表格,也就是数据的表头,以此来介绍数据,方便大家理解。

Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程

教程1. 我们打开Origin软件,输入数据。这里我们只需要输入log2Fold Change值,以及p-adj值。(也有很多人直接使用P值直接作图,这种未校正出来的在作图之后,上调下调基因会很多,p值调节之后,基因数目会减少)

Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程2. 将log2Fold Change值设置为X轴Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程3. 选中数据,点击火山图AppOrigin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程4. 设置对应的参数,即p值为0.05,Fold Change为2Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程5. 成图,那么这就是一个最原始的图谱了Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程6. 我们对各个标签进行调整,右击,删除其他的标签,只剩上调下调标签。Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程7. 将坐标轴也进行调整,字体统一改成Time New Rowan 字体,22号,加粗。来看一下效果。Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程8. 双击图中的点,将没有显著性差异表达的设置成灰色就可以了,或者你可以设置成自己喜欢的颜色。Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程9. 我们打开火山图自动生成的表格,来看一下上调基因和下调基因分别是多少,对应的行号就是上调下调的数目了。Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程10. 双击图中的标签,最后标注相关信息Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程11. 最终效果图Origin Pro如何快速绘制火山图教程  origin做图教程

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如作者信息标记有误,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。